清末,人称神医的喜来乐,在沧州认识了从京城来的维新派分子,靖王爷亲信鲁正明,鲁正明将喜来乐推荐到京城,为身染重病、已经被皇家太医王天和断言必死无疑的格格治病,喜来乐用裸体熏浴法将牙关紧闭的格格救活,靖王爷要留喜得乐在京城行医,引起太医王天和的嫉恨,对喜来乐加以谋害。喜来乐逃回沧州,王天和又在半路上设下埋伏——喜来乐妻子胡氏和情人赛西施听说喜来乐遇险,正悲痛不已,喜来乐悠哉悠哉地回到沧州。但王天和仍不死心,唆使药商孟庆合设圈套将喜来乐陷入大牢,幸得鲁正明将喜来乐搭救出来,为让喜来乐踏踏实实地在京城行医,靖王爷让人把赛西施开的饭馆“食为天”也搬到京城。自然,这让胡很是烦恼,她用种种招数整治花心的丈夫和赛西施……喜来乐才在京城住定,不料想,刚建好的药铺又被一把火烧掉……从此,喜来乐就不得不与王天展开一番又一番的较量,他的智慧一次又一次的让王天和出尽了洋相……
珍妃娘娘得了病,喜来乐几道菜谱就治好了她的病,皇上赏喜来乐黄袍马褂,徒弟德福穿上黄袍马褂到前门大街乱逛,王天和勾结顺天府的人,以欺君之罪,将喜来乐师徒二人打入死牢。赛西施冒险进顺天府大牢,喜来乐感动得说只要能活着出去,就将赛西施明媒正娶迎回家为妾,赛西施通过早年在沧州曾被喜来乐搭救、后科考为状元、在刑部当官的田魁,将喜来乐师徒营救出来。但是一到了老婆胡氏面前,喜来乐怎么也不敢提娶赛西施为妾的事,让赛西施十分伤感,赌气欲嫁给田魁。
本来对中医不屑一顾的德国医生斯密斯看到喜来乐奇奇怪怪的治病法儿,目瞪口呆,而喜来乐瞅见斯密斯给人动手术的刀剪锯也是瞠目结舌,这一中一西两个郎中争吵着竟成了朋友,到后来袁世凯的人追杀喜来乐时,斯密斯真搭救了他一命……喜来乐也忧国忧民,他恨日本人在甲午海战中杀了那么多的中国人,日本公使找他瞧病,他极尽捉弄手段。他趁看病的机会把那个把台湾割给日本人的李鸿章着实挖苦了一通。半夜里,北洋水师牺牲的提督的夫人犯病,请喜来乐前去救命,时时提防丈夫与赛西施幽会的胡氏死活不准他出门,怕老婆的喜来乐第一次对老婆发火……
山东一带闹瘟疫,朝廷派王天和前去督办,王天和与孟庆合贪污药银,购置质量低劣药材,再因为流民四处游荡,瘟疫东边消了西边又起,久久不能复旨,朝廷无奈,任喜来乐为钦差,喜来乐采用井泡药法,不论流民游荡到哪儿,只要喝井水就能治病,很快将瘟疫控制,王天和自叹不如,嫉恨越发厉害。
戊戌变法失败,鲁正明自杀未遂,朝廷命喜来乐救活鲁正明再杀,鲁正明宁死不愿上刑场,求喜来乐将自己治死,喜来乐在极度矛盾之中给鲁正明下了死药……他又被王天和折腾成新党分子,田魁为讨好慈禧太后,出卖恩人,将喜来乐判为死刑,即将嫁给田魁的赛西施怒斥田魁,撕碎了婚书。胡氏将下毒药的罪名担在自己身上,替丈夫上了刑场,她劝喜来乐娶了赛西施,赛西施好不感动。
民国初,发配回来的喜来乐回到京城,王天和的儿子登门求其救父一命,原来王天和得了怪病,命在旦夕。喜来乐怀着复杂的心情为王天和开了救命的药方子,但是,当王天和知道是喜来乐开的药时,他无颜吞咽被自己追杀、陷害了几十年的喜来乐的救命药,羞愧难当地死去。